計算生物概論

Introduction to Computaional Biology

計算生物概論的宗旨為計算生物學的基本原理介紹及實踐,目標是培養學生學習透過數學、統計及資訊等方法及概念來分析及探究生物學及醫學課題,本課程為大學部必修課,與朱智瑋教授共同授課,我的課程部分主要負責當代計算生物學簡介、基因/蛋白質序列比對及分析、基因表現分析、功能富集分析、巨量資料分析以及網路生物及網路醫學應用等。
本課程從110-112學年度 (近三年) 教學反映問卷平均分數達4.51。

課程理念及教學情況

(1)   帶入大量的例子幫助同學理解複雜的數學及統計公式。

(2)   結合互動式教學模式,例如:採用Slido即時互動式問答,讓同學可以即時回答並看到大家的答案統計,提升課堂參與意願。

(3)   配合當週課程內容補充介紹計算生物相關產業發展,幫助學生了解學習此課程的重要性。

(4)   時常分享年度計算生物領域最新技術及新知,幫助學生認識尖端科技

(5)   為了增添學習樂趣,課程教材中會適當融入時下流行的梗圖,提升學生的學習樂趣。

(6)   110-111學年度因應新冠疫情提供實體/視訊同步課程及課程錄製,透過影音平台幫助被隔離的同學學習及補課

(7) 適當進行作業難度調整以提高學習成效鑑別度

(8) 規劃了期中考前複習來幫助同學歸納學習方向及重點。

最新學生反饋

1.很感謝老師這學期的教導,我對於老師的教學方式很喜歡,搭配的作業難度適中,讓我們可以真的了解如何應用,真的謝謝老師
2.老師的教學詳細,ppt內容搭配老師的講解變得淺顯易懂,還有作業可以當課後複習,總體而言我很喜歡
3.老師上課教完觀念後還會舉例,學得很紮實
4.上課條理清晰,整體課程感覺不錯
5.老師教的很好吸收
6.老師的梗圖做得不錯

7.謝謝老師拯救我的成績!
【老師回饋】不客氣!主要是同學有認真寫作業、上課及考試,希望有幫助到你/妳們的學習。
【老師總回饋】謝謝同學的回饋,同學們的肯定都會轉化成老師精進教學的動力!

112-1 匿名 教學評鑑

歷年學生反饋

1.很感謝老師這學期的教導,我對於老師的教學方式很喜歡,搭配的作業難度適中,讓我們可以真的了解如何應用,真的謝謝老師
2.老師的教學詳細,ppt內容搭配老師的講解變得淺顯易懂,還有作業可以當課後複習,總體而言我很喜歡
3.老師上課教完觀念後還會舉例,學得很紮實
4.上課條理清晰,整體課程感覺不錯
5.老師教的很好吸收
6.老師的梗圖做得不錯

7.謝謝老師拯救我的成績!
【老師回饋】不客氣!主要是同學有認真寫作業、上課及考試,希望有幫助到你/妳們的學習。
【老師總回饋】謝謝同學的回饋,同學們的肯定都會轉化成老師精進教學的動力!

112-1 匿名 教學評鑑

1.老師上課非常認真,舉例也很容易幫助學生了解複雜的生物資訊概念,謝謝老師!
2. 老師上課講得很好很清楚很喜歡,每週最期待上的課
3.老師利用一些實例清楚傳達上課講授的概念,我較喜歡這樣的方式。 
4.老師教的內容很有趣,matrix 的計算很實用
5.老師上課認真有趣,很有收穫
6.老師教得比較好懂 
【老師總回饋】謝謝同學的回饋,同學們的肯定都會轉化成老師精進教學的動力!

111-1 匿名 教學評鑑

1.老師課程架構設計得很好,讓人淺顯易懂,搭配回家作業可以溫習課程內容
2.老師觀念都講得非常清楚,又認真授課,隔著螢幕都可以感受到老師的教學熱忱~謝謝老師的教導,老師辛苦了!
3.謝謝老師~~您講課內容很清楚也很詳細
4.計生好難,但幸好老師會舉例子,比較好理解,但還是好難。
【老師回饋】謝謝同學!老師會繼續努力,希望未來能更好被吸收理解~
5.老師和同學互動良好,人很好。
6.教得很好!!很有條理
【老師回饋】謝謝同學!。你/妳們班的平均成績也是高的很讓老師有成就感~
7.老師考前的總結很有幫助
【老師總回饋】謝謝同學!你/妳們能學到東西是最重要的。

110-1 匿名 教學評鑑

1.很喜歡這個老師 上課很有條理 PPT也做得很清楚,基本上認真做作業 期中都可以拿高分
【老師總回饋】謝謝同學的回饋及肯定

109-1 匿名 教學評鑑

 

分享年度計算生物領域最新技術及新知,幫助學生認識尖端科技

計算系統生物學教學理念及策略

計算系統生物學

Computational System Biology

隨著後基因體時代來臨,生物學家開始嘗試從基因體/蛋白質層次到生物網路層次去解析複雜的細胞行為。本課程包括介紹如何建構複雜生物網絡,以及介紹當代網絡生物學和系統生物學中使用的統計方法和數據集成,主要內容如下:
(1)如何處理來自基因調控,蛋白質—蛋白質相互作用,蛋白質複合物/模組之原始數據,包括數據處理、聚類、功能富集分析和生物網路之建立。
(2)介紹網路理論和網路模型的基礎知識。
(3)實例說明如何將基因體/蛋白質體數據用於網路重建、結合和驗證;以及如何透過這些生物網路探討疾病機制及辨識生物標記。
(4)本課程包含使用網路建置及分析工具(如: Cytoscape)的實用教程。
本課程從108學年度開設以來,111和112學年度 (近兩年) 教學反映問卷平均分數達4.81。

課程理念及教學情況

(1)幫助學生了解學習計算系統生物學之必要性及未來潛力

(2)著重課程規劃的完整性及連貫性

(3)善用動畫/影片等多媒體工具輔助教學

(4)善用教具提升教學效率與幫助學生理解。

學生反饋

1.老師上課說明得很清楚

【老師總回饋】謝謝同學的回饋,同學們的肯定都會轉化成老師精進教學的動力!

111-1 匿名 教學評鑑

網路生物學實作及應用

Implementation of Application of Network Biology

本課程屬於研究所實作課程(英文授課),涵蓋生物網絡的構建、統計/功能分析以及資料整合的實作。為了提升學習效率,平均每兩週就會透過課堂實作競賽來幫助學生複習學習內容,透過競賽也能激發學生學習動力;同時,鼓勵學生將所學融入自身專題研究或學位論文中,例如:每年幾乎都有大學部學生將期末實作專題用於推甄申請研究所之專題成果。主要內容如下:
(1)介紹生物網路相關資料庫及線上服務工具。
(2)Cytoscape的基礎及進階課程介紹,Cytoscape是一個用於分析及可視化複雜網路之開源軟體工具,並可進一步用於整合及分析多種生醫資料。
(3)實作處理來自基因調控、蛋白質-蛋白質相互作用和蛋白質複合物/模塊的原始資料以及分子網路建立、聚類和富集分析。
(4)實作使用基因組/蛋白質組數據進行生物網路重建、整合及分析。
(5)實作使用生物網路探索疾病機制和識別生物標記。

本課程在112學年度的教學反映問卷分數達5.0 (滿分)。

課程理念及教學情況

(1)幫助學生學習實作生物網路分析及生醫資料整合

(2)透過課堂實作競賽提升學習效率

(3)引導學生學以致用於個人專題或學位論文

學生反饋

1. 理論與實作並重,利用工具時老師也會仔細講解分析的緣由。實作部分讓我快速熟悉資料處理的流程,和被分析資料所看重的重點。

2. Well-organized course and well-designed practice for all of us. 

【老師總回饋】謝謝同學的回饋,同學們的肯定都會轉化成老師精進教學的動力!

112-2 匿名 教學評鑑

網路生物學實作及應用教學理念及策略